Государственную комиссию по делам религий беспокоит активное вовлечение представителей кыргызской национальности в различные религиозные организации протестантского толка. Об этом стало известно на парламентских слушаниях по вопросу религиозного образования.
«Этот вопрос вызывает повсеместные конфликты на религиозной основе в местных сообществах, пока на локальном уровне, создавая проблемы в вопросе сохранения стабильности. В частности, в 2010 году в Токтогуле здание общины «Свидетели Иеговы» было сожжено местными жителями. В 2011 году в селе Куланак Нарынской области из-за протестов сельчан община евангельских баптистов была вынуждена спешно хоронить своего адепта-подростка в огороде родителей. Аналогичные проблемы с захоронением кыргызов-протестантов встречаются во всех регионах страны и представляют серьезную угрозу межконфессиональному согласию в обществе», — отмечено в документах ведомства.